Когда на земле существовал суфизм, такая вариация здания – как ханака, было довольно распространено на территории страны. Раньше ханака использовалась как ночлег для уставших путников, со скромным интерьером, после стал красиво украшенным сооружением с роскошным декором.
Строительство ханаки Ходжи Зайнуддина началось в 16 веке, после чего, его стали использовать, как мечеть. В центре сооружения - большой зал, вокруг которого расположены маленькие комнаты.
В большой комнате проводились религиозные обряды, а маленькие предназначались для отдыха гостей Бухары, путников, и дервишей. Стены комнат были искусно оформлены зачаровывающей мозаикой, а на самом верху здания находится купол.
В комплекс Ходжи Зайнуддина входит не только сама ханака, но и хаус – который располагается неподалеку от ханаки. Комплекс назван именем Ходжи Зайнуддина, где были захоронены его останки.